Por defecto (al menos en mi instalación), Thunderbird responde a los mensajes debajo del texto citado. En mi opinión, esto es bastante molesto ya que si estás contestando a un email bastante largo mucha gente no se molesta en hacer scroll y piensa que has contestado con un mensaje vacio. Para cambiar esto y responder encima del texto citado hay que seguir los pasos:

Edit > Account settings > Composition and addressing > start my reply above quote

(Fuente)

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